Der Turmbau zu Babel, Öl auf Holz 114x155cm, Pieter Bruegel d. Ä. (1525/30 - 1569)
Ägyptisch-Orientalische Sammlung, angelegt in der 1. Hälfte des 19. Jahrhunderts
Antikensammlung (mit Ephesos-Museum in der Neuen Hofburg)
Gemäldegalerie; ehemaliger habsburgischer Bilderbesitz ab dem 15. Jahrhundert, grundlegend war die Sammlung von Erzherzog Leopold Wilhelm
Kunstkammer; Mittelpunkt der kaiserlichen Sammlungen, 1891 zusammengefasst, seit 1918 mit der Sammlung Este und Tapisseriensammlung
Weltliche und Geistliche Schatzkammer (der Kunstkammer angegliedert, aber in der Hofburg untergebracht)
Münzkabinett, antike, mittelalterliche und neuzeitliche Sammlung von Münzen und Medaillen, diesem angegliedert ist die Sammlung historischer Prägestempel in der Münze Österreich (Bestände seit etwa 1500).
In der Neuen Hofburg:
Hofjagd- und Rüstkammer, in ihrer Art neben der Armeria Real in Madrid die bedeutendste der Welt; umfasst Sammlungen von Kaiser Friedrich III. bis zu Kaiser Franz Joseph I.; 1888 im Hauptgebäude vereinigt, seit 1935 am heutigen Standort
Sammlung alter Musikinstrumente (Renaissance- und Barockinstrumente aus der Ambraser Kunstkammer und der so genannten "Estensischen Sammlung")
große umfassende Bibliothek aus den Beständen der historischen Sammlungen, vor allem des Münz- und Antikenkabinetts, 1882 zusammengeschlossen (redigiert seit 1883 das ursprünglich vom Oberstkämmereramt herausgegebene "Jahrbuch der Kunsthistorischen Sammlungen des Allerhöchsten Kaiserhauses").
Sammlung historischer Prunk- und Gebrauchswagen (Wagenburg in Schönbrunn);
Außenstelle auf Schloss Ambras mit historisch rekonstruierter Antikensammlung, Kunst- und Rüstkammer sowie der 1975 aus Schönbrunner Beständen und deponierten Galeriebildern zusammengestellten Porträtgalerie zur Geschichte Österreichs.